Préparation d’échantillon et analyse en carte microfluidique pour la détection rapide de bactéries dans l’eau de mer

Notre objectif est de développer un système automatisé capable de détecter sur le terrain la présence de E.coli (<2000 CFU/100 mL) dans l’eau de baignade (mer, lac, rivière) en moins de 2h. Pour cela, nous avons intégré un protocole biologique complexe en carte microfluidique. En particulier, nous avons conçu et validé un réactif qLAMP pour la détection de E.coli. La carte microfluidique intègre et automatise : concentration de l’échantillon, purification, lyse des bactéries, élution de l’ADN des bactéries dans le réactif de détection LAMP, ainsi que deux contrôles simultanés : un contrôle négatif et un contrôle de non inhibition pour garantir la validité du résultat. Enfin, un banc microfluidique contrôle les commandes pneumatiques, le système de chauffage et la détection en fluorescence.