SporeBiotech - Exploration de la diversité des bactéries sporulées du sol pour découvrir de nouveaux agents de biocontrôle

Les bactéries sporulées sont reconnues pour leur résistance, leur capacité de croissance variées et la production de molécules actives. Cependant, de nombreuses bactéries ne peuvent pas être cultivées en laboratoire. La méthode iChip permet d'apprivoiser les bactéries dîtes incultivables. Cette étude vise à développer une méthode iChip spécifique aux bactéries sporulées à des fins d'étude et de criblage de leur activité antibactérienne contre 2 pathogènes alimentaires. L'iChip modifiée a atteint un taux de récupération des spores bactériennes de 47 %, dépassant les études précédentes (28 %). Parmi les 757 isolats, 355 étaient des bactéries sporulées appartenant à 23 genres et 66 isolats étaient non identifiés suggérant la récupération de nouvelles espèces microbiennes. Le criblage antibactérien a révélé une inhibition de S. enterica pour 1,4 % des isolats (5) et de S. aureus pour 7,9 % des isolats (28). La méthode iChip proposée permet une récupération plus importante des bactéries sporulées. L’investigation des activités biotechnologiques de ces isolats, actuellement en cours, permettra potentiellement la découverte de nouveaux agents de biocontrôle pour l'industrie alimentaire.