Journée Microbiotes et Santé 2026

19 mai 2026 | Villeurbanne, France

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Samuel Alizon

Directeur de Recherche

CNRS

Paris, France

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Académiques / Centres de compétences

Villeurbanne, France

Institut Lumière Matière du CNRS et de l’UCBL, est un laboratoire de recherche de physique et chimie spécialisé dans la synthèse et la caractérisation de la matière. Notre équipe multidisciplinaire apporte des solutions aux verrous techniques en s’appuyant sur son expertise scientifique sur des projets dans les domaines du développement de modèle d’organe pour étudier les réactions de type mécanique, de capteurs photoniques pour la détection de pathogène sans réactif chimique. Nous collaborons activement avec des partenaires académiques et industriels pour faire avancer la recherche et développer de nouvelles applications technologiques.
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Sur moi

Samuel Alizon est Directeur de Recherche au CNRS et dirige l'équipe Écologie et évolution de la santé au sein du Centre Interdisciplinaire de Recherches en Biologie au Collège de France à Paris. En tant que théoricien de la biologie, il utilise approches interdisciplinaires, notamment la modélisation, pour étudier les questions liées aux interactions entre notre espèce et ses microbes. Ses recherches portent en particulier sur les virus humains (HPV, VIH, VHC ou SARS-Cov-2) et sur le microbiote vaginal.

Après une thèse visant à comprendre pourquoi les parasites nuisent à leurs hôtes à l'aide de modèles mathématiques, il a travaillé comme professeur adjoint à l'université Queen's de Kingston (Canada) et comme chercheur post-doctorant à l'ETH de Zurich (Suisse), où il a étudié la virulence du VIH. En 2010, il a été recruté comme chercheur au CNRS au laboratoire MIVEGEC à Montpellier, puis promu directeur de recherche en 2017. En collaboration avec des collègues de l'hôpital universitaire de Montpellier et grâce à un financement du Conseil Européen de la Recherche (ERC), il a mené des projets de recherche clinique, notamment l'étude PAPCLEAR visant à mieux comprendre l'écologie des infections à papillomavirus (HPV) chez les jeunes femmes. Depuis la mi-mars 2020 jusqu'à 2024, son équipe a analysé et modélisé l'épidémie de COVID-19 en France. Maintenant basé au CIRB à Paris, sa nouvelle équipe a publié une des premières études d'ampleur sur le microbiote vaginal chez des femmes vivant en France ou encore un des premiers modèles mathématiques sur ce microbiome. Il est l'auteur de nombreux articles de recherche et d'un ouvrage de vulgarisation en français (Évolution, écologie et pandémies, publié chez Points/Seuil en 2020).

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