Julie Flecheux

Actuellement en 3ᵉ année de thèse à l’Institut des Sciences Analytiques (Université Claude Bernard Lyon 1), je suis spécialisée en analyse de micro-organismes par protéomique et spectrométrie de masse. Mes travaux portent sur le développement de méthodes permettant l’identification rapide et fiable de micro-organismes dans des matrices complexes.

Ces approches trouvent notamment des applications en microbiologie clinique, avec le diagnostic rapide de maladies infectieuses telles que les septicémies, permettant l’identification du pathogène parmi un panel de plus de 1200 espèces ainsi que la détection de protéines de résistances aux antibiotiques, en moins d’une heure après positivité de l’hémoculture.

En parallèle, j’applique ces stratégies à l’étude des microbiotes, avec l’objectif de proposer des outils analytiques capables de caractériser rapidement la composition microbienne et son activité fonctionnelle. Une preuve de concept a démontré la pertinence et la complémentarité de la protéomique par rapport aux approches conventionnelles telles que la métagénomique ou la culturomique.